Sektor za državno računovodstvo i računovodstvo neprofitnih organizacija obavlja poslove koji se odnose na:
- normativno uređenje proračunskog računovodstva i računovodstva neprofitnih organizacija;
- razvijanje sustava računskog plana za proračunsko i neprofitno računovodstvo;
- davanje prijedloga unaprjeđenja knjigovodstvenog sustava Glavne knjige državnog proračuna;
- usklađenje Glavne knjige s analitičkim evidencijama;
- sudjelovanje u izradi uputa o načinu planiranja, izvršavanja i evidentiranja projekata financiranih iz sredstava Europske unije;
- sudjelovanje u pripremi Naredbe o načinu uplaćivanja prihoda proračuna, obveznih doprinosa te prihoda za financiranje drugih javnih potreba;
- sastavljanje polugodišnjeg i godišnjeg izvještaja o izvršenju državnog proračuna;
- pružanje podrške statističkom izvještavanju prema Europskoj uniji pripremom izvornih podataka;
- razvijanje analitičkog okvira financijskog izvještavanja;
- davanje uputa i mišljenja u vezi sa sastavljanjem financijskih izvještaja proračunskih i izvanproračunskih korisnika proračuna;
- sastavljanje financijskih izvještaja za državni proračun;
- sastavljanje konsolidiranih financijskih izvještaje;
- sudjelovanje u provođenju financijskih kontrola zakonitog i namjenskog korištenja proračunskih sredstava u skladu sa zakonskim i podzakonskim propisima iz područja fiskalne odgovornosti;
- obavljanje i drugih poslove iz svoga djelokruga.
U Sektoru za državno računovodstvo i računovodstvo neprofitnih organizacija, ustrojavaju se:
- Služba za uređenje računovodstvenog sustava proračuna
- Služba za državno knjigovodstvo
- Služba za neprofitno računovodstvo i izvještavanje
- Služba za analizu financijskih izvještaja proračuna i podršku statističkom izvještavanju prema Europskoj uniji
